Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms