Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRC1O43663 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRC1O43663 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRC1O43663 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRC1O43663 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRC1O43663 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRC1O43663 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms