Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF1O43189 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHF1O43189 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHF1O43189 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PHF1O43189 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHF1O43189 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF1O43189 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF1O43189 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF1O43189 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF1O43189 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHF1O43189 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms