Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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NPHP1O15259 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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NPHP1O15259 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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NPHP1O15259 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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NPHP1O15259 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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NPHP1O15259 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NPHP1O15259 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
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