Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP290O15078 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP290O15078 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP290O15078 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP290O15078 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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CEP290O15078 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP290O15078 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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CEP290O15078 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP290O15078 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP290O15078 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP290O15078 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP290O15078 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP290O15078 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP290O15078 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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CEP290O15078 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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CEP290O15078 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP290O15078 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP290O15078 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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