Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARVCFO00192 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms