Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PMD0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PMD0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E9PMD0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
E9PMD0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E9PMD0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E9PMD0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E9PMD0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E9PMD0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E9PMD0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms