Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms