Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNF879B4DU55 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms