Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HMGB1P1B2RPK0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMGB1P1B2RPK0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms