Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COLCA2A8K830 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms