Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC169A6NNP5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms