Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM200CA6NKL6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM200CA6NKL6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms