Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf92A6NGG3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms