Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC182A6NF36 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms