Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POTEFA5A3E0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POTEFA5A3E0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms