Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA3Q9Y6Q9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NCOA3Q9Y6Q9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
NCOA3Q9Y6Q9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
NCOA3Q9Y6Q9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
NCOA3Q9Y6Q9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCOA3Q9Y6Q9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms