Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPTNQ9Y639 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPTNQ9Y639 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPTNQ9Y639 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPTNQ9Y639 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms