Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PCDHB6Q9Y5E3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCDHB6Q9Y5E3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PCDHB6Q9Y5E3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PCDHB6Q9Y5E3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB6Q9Y5E3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms