Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FARP1Q9Y4F1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FARP1Q9Y4F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FARP1Q9Y4F1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FARP1Q9Y4F1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FARP1Q9Y4F1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FARP1Q9Y4F1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms