Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R5

DOPEY2, Protein dopey-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DOPEY2Q9Y3R5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DOPEY2Q9Y3R5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DOPEY2Q9Y3R5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DOPEY2Q9Y3R5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DOPEY2Q9Y3R5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DOPEY2Q9Y3R5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DOPEY2Q9Y3R5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms