Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUDCQ9Y266 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUDCQ9Y266 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NUDCQ9Y266 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUDCQ9Y266 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NUDCQ9Y266 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NUDCQ9Y266 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms