Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIPT1Q9Y234 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIPT1Q9Y234 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIPT1Q9Y234 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIPT1Q9Y234 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms