Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
THSD7AQ9UPZ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
THSD7AQ9UPZ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
THSD7AQ9UPZ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
THSD7AQ9UPZ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
THSD7AQ9UPZ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
THSD7AQ9UPZ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
THSD7AQ9UPZ6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms