Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMG5Q9UPR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMG5Q9UPR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMG5Q9UPR3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMG5Q9UPR3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms