Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
BARX2Q9UMQ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BARX2Q9UMQ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BARX2Q9UMQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BARX2Q9UMQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BARX2Q9UMQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BARX2Q9UMQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BARX2Q9UMQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms