Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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