Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRFN2Q9ULH4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRFN2Q9ULH4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRFN2Q9ULH4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRFN2Q9ULH4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRFN2Q9ULH4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRFN2Q9ULH4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms