Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF346Q9UL40 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF346Q9UL40 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF346Q9UL40 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF346Q9UL40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF346Q9UL40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms