Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FBXO3Q9UK99 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FBXO3Q9UK99 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
FBXO3Q9UK99 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
FBXO3Q9UK99 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FBXO3Q9UK99 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
FBXO3Q9UK99 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms