Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK85

DKKL1, Dickkopf-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKKL1Q9UK85 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKKL1Q9UK85 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKKL1Q9UK85 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKKL1Q9UK85 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKKL1Q9UK85 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DKKL1Q9UK85 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DKKL1Q9UK85 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKKL1Q9UK85 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKKL1Q9UK85 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms