Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDF2Q9UK05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDF2Q9UK05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDF2Q9UK05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GDF2Q9UK05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF2Q9UK05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF2Q9UK05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms