Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRLS1Q9UJA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
CRLS1Q9UJA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRLS1Q9UJA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRLS1Q9UJA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRLS1Q9UJA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLS1Q9UJA2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLS1Q9UJA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRLS1Q9UJA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms