Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms