Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LPAR3Q9UBY5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPAR3Q9UBY5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPAR3Q9UBY5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms