Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS7AQ9UBW8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPS7AQ9UBW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COPS7AQ9UBW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COPS7AQ9UBW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COPS7AQ9UBW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
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