Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DKK4Q9UBT3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DKK4Q9UBT3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DKK4Q9UBT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DKK4Q9UBT3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DKK4Q9UBT3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DKK4Q9UBT3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DKK4Q9UBT3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms