Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MGAT4CQ9UBM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MGAT4CQ9UBM8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MGAT4CQ9UBM8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MGAT4CQ9UBM8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGAT4CQ9UBM8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms