Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPRR3Q9UBC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPRR3Q9UBC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPRR3Q9UBC9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPRR3Q9UBC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPRR3Q9UBC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms