Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GALPQ9UBC7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GALPQ9UBC7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GALPQ9UBC7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GALPQ9UBC7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GALPQ9UBC7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GALPQ9UBC7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALPQ9UBC7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GALPQ9UBC7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms