Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SLAIN2Q9P270 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SLAIN2Q9P270 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
SLAIN2Q9P270 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SLAIN2Q9P270 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SLAIN2Q9P270 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SLAIN2Q9P270 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SLAIN2Q9P270 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SLAIN2Q9P270 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SLAIN2Q9P270 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms