Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYOFQ9NZM1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYOFQ9NZM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYOFQ9NZM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYOFQ9NZM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYOFQ9NZM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYOFQ9NZM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYOFQ9NZM1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms