Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD4Q9NXE4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMPD4Q9NXE4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMPD4Q9NXE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMPD4Q9NXE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMPD4Q9NXE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD4Q9NXE4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD4Q9NXE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD4Q9NXE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMPD4Q9NXE4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms