Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHCHD3Q9NX63 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHCHD3Q9NX63 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD3Q9NX63 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD3Q9NX63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms