Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRNAU1APQ9NX07 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNAU1APQ9NX07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNAU1APQ9NX07 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRNAU1APQ9NX07 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms