Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PKDREJQ9NTG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKDREJQ9NTG1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PKDREJQ9NTG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKDREJQ9NTG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PKDREJQ9NTG1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms