Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3GQ9NS98 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3GQ9NS98 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3GQ9NS98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEMA3GQ9NS98 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEMA3GQ9NS98 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEMA3GQ9NS98 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3GQ9NS98 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms