Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 CDK1-207ENST00000519078 723 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.942e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CDK1-208ENST00000519760 276 ntTSL 30.51□□□□□ -2.332e-11■■■■■ 57.6
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-207ENST00000473420 922 ntTSL 329.16■■■□□ 2.268e-9■■■■■ 57.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-215ENST00000498160 877 ntTSL 526.89■■□□□ 1.98e-9■■■■■ 57.5
DROSHAQ9NRR4 KLHDC4-223ENST00000568499 445 ntTSL 322.68■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 57
DROSHAQ9NRR4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.052e-20■■■■■ 56.6
DROSHAQ9NRR4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.162e-20■■■■■ 56.6
DROSHAQ9NRR4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.754e-7■■■■■ 56.5
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-202ENST00000428361 842 ntTSL 523.91■■□□□ 1.428e-9■■■■■ 56.5
DROSHAQ9NRR4 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC8.55□□□□□ -1.042e-12■■■■■ 56.4
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-214ENST00000497677 998 ntTSL 224.5■■□□□ 1.518e-9■■■■■ 56.4
DROSHAQ9NRR4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 56.1
DROSHAQ9NRR4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 56.1
DROSHAQ9NRR4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 56.1
DROSHAQ9NRR4 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 517.26■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 55.8
DROSHAQ9NRR4 NKTR-209ENST00000465584 3839 ntTSL 23.67□□□□□ -1.822e-12■■■■■ 55.8
DROSHAQ9NRR4 PNCK-227ENST00000475172 877 ntTSL 537.55■■■■□ 3.65e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.435e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 231.27■■■□□ 2.65e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.385e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-220ENST00000465303 868 ntTSL 429.57■■■□□ 2.325e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-219ENST00000463548 783 ntTSL 528.64■■■□□ 2.185e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-212ENST00000434652 311 ntTSL 526.53■■□□□ 1.845e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-224ENST00000472324 2143 ntTSL 1 (best)25.96■■□□□ 1.755e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-222ENST00000466638 1204 ntTSL 225.27■■□□□ 1.645e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-214ENST00000439087 754 ntTSL 522.91■■□□□ 1.265e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-232ENST00000489536 836 ntTSL 222.52■■□□□ 1.25e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-211ENST00000433470 717 ntTSL 521.71■■□□□ 1.075e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 PNCK-205ENST00000411968 557 ntTSL 514.91□□□□□ -0.025e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 55.7
DROSHAQ9NRR4 WWP2-207ENST00000566463 1971 ntTSL 221.9■■□□□ 1.15e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 WWP2-217ENST00000569297 2462 ntTSL 220.45■□□□□ 0.865e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 WWP2-214ENST00000568818 563 ntTSL 517.09■□□□□ 0.335e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.15e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 WWP2-203ENST00000544162 2723 ntTSL 215.34■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 55.5
DROSHAQ9NRR4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.46e-7■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)21.54■■□□□ 1.046e-7■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 320.85■□□□□ 0.936e-7■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 214.72□□□□□ -0.056e-7■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 414.11□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.668e-9■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-205ENST00000452977 818 ntTSL 523.91■■□□□ 1.428e-9■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 322.07■■□□□ 1.128e-9■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.038e-9■■■■■ 55.4
DROSHAQ9NRR4 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 232.54■■■□□ 2.83e-9■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.074e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-210ENST00000493053 1096 ntTSL 524.65■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-206ENST00000465936 292 ntTSL 324.41■■□□□ 1.54e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-203ENST00000460362 414 ntTSL 321.87■■□□□ 1.094e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-205ENST00000462760 573 ntTSL 218.77■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-204ENST00000460820 622 ntTSL 217.78■□□□□ 0.444e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5C1-207ENST00000472202 782 ntTSL 24.78□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 55.2
DROSHAQ9NRR4 ATP1A1-204ENST00000418797 654 ntTSL 331.32■■■□□ 2.62e-7■■■■■ 55.1
DROSHAQ9NRR4 ATP1A1-208ENST00000488733 1728 ntTSL 230.25■■■□□ 2.432e-7■■■■■ 55.1
DROSHAQ9NRR4 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 55.1
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-213ENST00000486164 781 ntTSL 321.04■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 55
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DROSHAQ9NRR4 ADAM15-210ENST00000461234 1069 ntTSL 235.57■■■■□ 3.285e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-218ENST00000474709 731 ntTSL 533.59■■■□□ 2.975e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.365e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.195e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.195e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-210ENST00000512768 1056 ntTSL 1 (best)27.33■■□□□ 1.975e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 227.1■■□□□ 1.935e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.775e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.645e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-208ENST00000487481 987 ntTSL 224.8■■□□□ 1.565e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-206ENST00000475573 781 ntTSL 324.8■■□□□ 1.565e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.395e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.185e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 522.08■■□□□ 1.125e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.15e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.085e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.895e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.855e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.815e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.785e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.785e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-225ENST00000526491 3091 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.745e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-227ENST00000529473 3016 ntTSL 1 (best)19.58■□□□□ 0.735e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.715e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.685e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.465e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 PAFAH1B1-208ENST00000574468 1021 ntTSL 211.92□□□□□ -0.55e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 59.21□□□□□ -0.945e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 PAFAH1B1-205ENST00000571495 1503 ntTSL 28.95□□□□□ -0.985e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 PAFAH1B1-201ENST00000397193 1277 ntTSL 27.64□□□□□ -1.195e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)5.84□□□□□ -1.475e-11■■■■■ 54.8
DROSHAQ9NRR4 MXI1-207ENST00000453116 803 ntTSL 537.74■■■■□ 3.632e-6■■■■■ 54.6
DROSHAQ9NRR4 MXI1-208ENST00000460667 782 ntTSL 337.01■■■■□ 3.512e-6■■■■■ 54.6
DROSHAQ9NRR4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.942e-6■■■■■ 54.6
DROSHAQ9NRR4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.492e-6■■■■■ 54.6
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