Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARHGEF3Q9NR81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARHGEF3Q9NR81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGEF3Q9NR81 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGEF3Q9NR81 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGEF3Q9NR81 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms