Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PFDN4Q9NQP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PFDN4Q9NQP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFDN4Q9NQP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN4Q9NQP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PFDN4Q9NQP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN4Q9NQP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms